Hovedformålet med projektet er at sikre en effektiv og virkningsfuld gennemførelse af de operationelle programmer: POPC og POIG ved at sikre de nødvendige menneskelige ressourcer og betingelser, der sikrer, at institutionen fungerer gnidningsløst. POPT stiller finansielle midler til rådighed til støtte for processer inden for forberedelse, forvaltning, gennemførelse, overvågning, evaluering og kontrol af gennemførelsen samt oplysning, fremme og evaluering af EU-programmer.