A) I det nuværende F & D- projekt integrerer vi genomforskningsteknologier i forskningsprogrammer i forskningsworkshopperne. Formålet med projektet er at sikre, at vores forskningsprogrammer er internationalt førende inden for deres ekspertiseområde, og at vi takket være de forskellige applikationer og teknologiske udviklinger, der er implementeret i projektet, skaber et bæredygtigt center for F & D & I excellence. Det nuværende forskningsprogram er baseret på udviklingen af F & U-infrastruktur i det vindende GINOP-2.3.3.-15 "Udvikling af F & U-infrastrukturen i anlægsvidenskabelig videns- og servicecenter baseret på banebrydende teknologier på universitetet i Pannonia". I dette udbud købes bl.a. en Titan MC microarray-enhed ved hjælp af Axiom-teknologi, som er blevet markedsført for 5 år siden og kun er tilgængelig på vores institution i den centraleuropæiske region i 18 lande. Axiom-systemet tilbyder en eksponentielt bredere studiepalet end noget andet mikroarray-system, og repeterbarheden af eksperimentelle resultater er næsten 100 %. Desuden er systemet tilstrækkeligt fleksibelt, så det er også velegnet til array udvikling baseret på sin egen forskning. En anden QuantStudio 7 qPCR enhed (LifeTechnologies) er købt i vores infrastruktur udvikling udbud, som er et andet centralt element i de undersøgelser, der udføres i dette projekt. Det tredje nøgleelement er Illuminas næste generation af sekventeringsteknologi, designet til små prøvetest, men også til kort sekventering af de største genomer, og derfor ekstremt fleksibelt system, NextSeq 500 System, som vi ønsker at erhverve i det nuværende projekt. Den kombinerede tilgængelighed af disse tre højteknologiske genomforskningsteknologier giver komplekse, fleksible og meget brede testmuligheder som følger: 1. I en enkelt reaktion, kan vi teste hundredvis af prøver med mikroarray teknologi. Vi får titusindvis af genomer pr. prøve. Derfor anvendes denne metode til samtidig hurtig påvisning af variationer af et stort antal kendte gener. De specifikke omkostninger ved en prøve er en brøkdel af den samlede genomiske eller transkriptive sekventering. 2. I hvert forskningsprogram er de mest gunstige og ugunstige genotyper/prøver sekvenseret ved hjælp af NextSeq. Her, i det første trin, er et referencegenom skabt fra den mest værdifulde genotype af testen, derefter transskriptom sekventering på den samme genotype udføres, og de arbejdende gener er lokaliseret i referencegenomet. På samme måde forbereder vi også afskriften af den mest ugunstige genotype og karakteriserer forskellene mellem de to genotyper. De referencegenomer, der er tilgængelige i offentlige databaser, vil naturligvis være til stor hjælp ved udarbejdelsen af referencegenomer fremstillet af vores egne værdifulde genotyper. 3. Ekspressionerne af gener og genvarianter, der styrer egenskaben som defineret i tidligere undersøgelser, analyseres ved hjælp af qPCR for ekspressionsændringer i forskellige udviklingsstadier, væv og miljøvirkninger. Ved hjælp af disse test kan den genetiske baggrund af komplekse egenskaber såsom biotisk stressrespons, kvælstofudnyttelseskapacitet eller tørketolerance fortolkes. Blandt programmerne i forskningsworkshop-grupperne, kartoffelresistensavl, rodstammer og adelsavl, paprikaavl, markafgrøder langsigtede eksperimenter og svineavl har en historie på mere end 50 år og har stor international anerkendelse inden for deres ekspertiseområde. De har en historie i årtier, og takket være det internationale samarbejde i de seneste år udvikler vores forskning i fjerkræfoder sig dynamisk. Ny forskning er vores omfattende program for genomforskning og teknologisk udvikling af honningbier, hvor vi også samarbejder med partnere fra Ungarn og udlandet. Derudover har vi en pære-, kartoffel- og druegenbank, der indeholder værdifulde genressourcer, især resistensgener, som er et vigtigt skridt i retning af at gøre vores avlsprojekter mere effektive. B) R & D opgaver For at blive afsluttet Titan MC platform (Axiom microarray teknologi) udkom for 5 år siden, mens NextSeq og QuantStudio 7 qPCR blev udgivet 2-3 år siden. Nyheden i forskningen er opførelsen af disse 3 højteknologiske teknologier på hinanden: mikroarray-teknologi beskriver de enkelte testmaterialer i store prøveundersøgelser og sammenligner derefter de DNA-profiler, der er opnået af NextSeq, de mest gunstige og ugunstige genotyper for de testede egenskaber, og ekspressionsprofilen for gener, der bestemmer egenskabskontrollen (udviklingsfase, miljøpåvirkning, vævstype osv.), undersøges af qPCR. Baseret på de opnåede resultater, nye, specifikke, dvs. ejeren
