A) Vi understreger, at deltagerne i udbuddet satte de mål for rigeligt to år siden, de arbejder sammen om disse planer på daglig basis, og kan producere en række opmuntrende foreløbige resultater. På grund af knappe ressourcer er disse resultater ikke systematiske: vi har arbejdet med få aktive molekyler, få patogener, og in vivo test mangler. En vellykket ansøgning ville udfylde dette hul. Vores arbejdsplan har to delprogrammer, som vi fremlægger, og som skitserer de foreløbige resultater, planerne og de forventede gennembrudsresultater. Delprogram 1 1.1 Test af antibiotikaresistente stammer mod AMP (Pál), komplet genomsekventering (Kondorosi) og bioinformatik analyse af resultater (Papp) 1.2 AMP — lavmolekunde antibiotikakombinationer (Pál, Papp) 1.3 Sammenfatning af nye byggesten til AMP mimetic foldamers (Fülöp) skift og rensning af sekvenser (Martinek, Tóth) og biofysisk karakterisering (Martinek) 1.4 Test af AMP mimetic foldamers in vitro og in vivo (Pál, Kondorosi) og toksicitetstest (Földesi) 2 delprogram 2.1 Produktion af SSB-C foldameranaloger (Martins), stabilisering ved sidekædebrodging (Tóth), syntese af krævede monomerer (Fülöp) og in vitro-test for PPI-hæmmere. 2.2 SSB-C Mymetik — Strukturel karakterisering af Reco-WH Interaktion (Martinek) 2.3 SSB-C Analogs Optimering af Dynamic Covalent Library Method. Cellepenetrationsundersøgelser (Martin) 2.4 Real-time in vitro evolutionære undersøgelser, antibakteriel test (Pál, Papp), toksicitetsundersøgelser (Göldesi). B) 1. DELPROJEKT: Antimikrobielle peptider AMP er korte peptider med en divergerende struktur og funktion, der beskytter værten mod forskellige mikrobielle infektioner. De findes i planter, dyr, svampe og er en del af et primært system til beskyttelse mod patogener. [Natur 2002, 415, 389] Selv om de er forblevet effektive i udviklingen, rejser deres praktiske anvendelse en række problemer, hvoraf to er koncentreret om: 1) På nuværende tidspunkt er der alvorlig debat om udviklingen af modstandsdygtighed over for disse molekyler og, hvis det er tilfældet, hvilke skadelige bivirkninger det kan have. [FEMS Microbiol Lett 2012, 330, 81] 2) Et yderligere problem forud for klinisk brug af peptider er, at de undertiden er vanskelige at administrere og absorbere og kan nedbrydes af humane proteinnedbrydende enzymer (proteases). Deres in vivo-stabilitet er ofte utilfredsstillende. Vores indledende undersøgelser viser, at disse problemer kan overvindes. Desuden er AMP'er særligt effektive mod multiresistente bakterier. For at gøre dette er det nødvendigt at vælge AMP, mod hvilke resistens ikke observeres. Disse molekyler er grundlaget for den videre udvikling: samtidig med at vi bevarer ovenstående gunstige strukturelle og funktionelle egenskaber, designer vi såkaldte peptidomimetiske foldamermolekyler. Vores mål er at vise, at kombinationen af disse peptidomimetika med antibiotika er usædvanlig effektiv til bekæmpelse af resistens. Foreløbige resultater og planer: Achilles hæl af multidrug resistente bakterier kan angribes af AMP. Detaljerede genetiske, biokemiske, fænotipus-test og genom-level ekspressionstest af grupperne under ledelse af Csaba Pál, Balázs Papp og Éva Kondorosi bekræftede, at membranstrukturen, stivheden og membranproteinsammensætningen af resistente bakterier ofte ændrede sig betydeligt. [NAT-Kommun 2014, 5, 4352; Mol Syst Biol 2013, 9, 700] Da de fleste AMP primære mål er bakteriemembranen, er det blevet foreslået, at antibiotikaresistens også påvirker modtageligheden for AMP. Resultatet var uventet og meget interessant. 90 % af multiresistente stammer er blevet overfølsomhed over for flere AMP'er: sammenlignet med baseline-kontrolstammer steg følsomheden af disse stammer generelt med to til tre gange. Dette viser, at der er store omkostninger ved at udvikle antibiotikaresistens, som potentielt kan udnyttes ved samtidig administration af antibiotika og AMP. Effektiv AMP antibiotisk kombinationsbehandling. I næste skridt fokuserer partnerne på to centrale spørgsmål. Er der nogen AMP, der administreres sammen med antibiotika (a) hæmmer de novo-resistens in vitro og (b) effektivt dræber multiresistente bakterier. Deres undersøgelser fokuserer på to AMP'er: NCR335 peptid og selfinin peptid familie til PGLA. For begge peptider forblev 90-100 % af multiresistente stammer meget følsomme over for dem. Foreløbige resultater: a) Tetracyclin og ciprofloxacin resistente bakterier er blevet mere følsomme over for disse stoffer ved at tilføje PGLA til antibiotikaet. Virkningen er dramatisk i flere tilfælde: antibiotikafølsomheden øges 10-50 gange med en meget lav (subinhibitorisk) PGLA-dosis.
