Изпълняван като част от неконкурентен проект, Гаранционният фонд ще предлага гаранции на финансовите институции (кредитни банки), които предоставят капитал на предприемачите за техните иновативни дейности, включително изпълнението на резултатите от научноизследователската и развойната дейност. Поемането от Гаранционния фонд на значителна част от риска, поет от финансовите институции, ще създаде стимул за ангажиране на частен капитал във финансирането на иновативни проекти. Операцията ще предоставя също така подкрепа под формата на лихвени субсидии по заеми в съответствие с член 37, параграф 7 от Регламент (ЕС) № 1303/2013.