RNA-förändringar observeras på specifika cell-RNA-rester och spelar en nyckelroll i deras mognad och funktionalitet. Av de kemiska förändringar som beskrivs är nukleotidmetylering den vanligaste. I cellen känner cytoplasmasensorer igen omodifierade exogena RNA och aktiverar produktionen av typ I-interferon för att etablera ett antiviralt tillstånd. Vissa posttranskriptionella förändringar i viralt RNA såsom m6A-modifieringen som finns hos virus som hepatit C och Zika och påverkar replikationen och aktiveringen av det antivirala svaret. Vid infektioner med humana immunbristvirus, herpes i samband med Kaposi sarkom och influensa, innehåller dessa virala RNA m6A-förändringar, vilket påverkar virusreplikationen. Effekten av posttranskriptionella förändringar i viralt genomiskt RNA (gRNA) under infektion och det medfödda immunsvaret är hittills okänt. Målen är följande: I) kartlägga RNA-förändringar av olika RNA-virus (flavivirus, alfavirus, rabdovirus och picornavirus) under viruscykeln; II) bestämma förändringar i gRNA på biogenesen och mognad av virusgenomet i den mänskliga cellens organeller, III) att studera de förändringar som identifierats när det gäller igenkänning av virusgenom med hjälp av RLR-sensorer och aktiveringen av typ I-interferonvägen i målcellen.