ISE syftar till att identifiera små och medelstora företag i behov av att skapa mervärde och påskynda innovation genom att underlätta gränsöverskridande förbindelser, samarbeten och tekniköverföring med andra små och medelstora företag, kunskapsinstitut och experter. Projektet syftar till att leverera två huvudsakliga stödbanor: ”införa innovation” (WP1) till ett antal prioriterade sektorer och ”inkubations- och klusterinnovation” (WP2 och 3) bland små och medelstora företag med tillväxtpotential från sektorer som lyfts fram i regionala S3-strategier. Många partnerregioner är ”innovationsföljare”. ISE kommer att öka antalet små och medelstora företag som innoverar och ta innovationer till nya marknader.