Den pågående coronapandemin runt om i världen har visat på det akuta behovet av snabb och ekonomiskt effektiv virusdetektering. P. J. Šafárik University i Košice, i samarbete med SAFTRA Photonics s.r.o. och AUSYS s.r.o., föreslår att utveckla en metod för snabb, selektiv och mycket känslig detektion av SARS-CoV-2 virus, som kommer att fångas specifikt på ytan av fotonisk nanostruktur chips. Inom projektet kommer chipytan att funktionaliseras genom nanolayering av molekyler av specifika proteiner som utvecklats genom metoden för kontrollerad evolution av utvalda proteinplattformar. Bildandet av nanolager av proteiner på detektionschipet kommer att utföras med hjälp av kontrollerad specifik kemisk konjugation för att uppnå optimal bindningseffektivitet och reproducerbarhet för detektionsegenskaper. När ett prov av det inaktiverade viruset har applicerats på det funktionaliserade chippet kommer förekomsten av viruset att upptäckas på grundval av det ökade ramanovskyspektret med hjälp av ytplasmamoner. BioRAMASCOPE kommer att utvecklas för att upptäcka signalen från funktionaliserade chips. BioRAMASCOPE kommer att uppfylla de särskilda kraven på de detektionsgränser och driftsäkerhet som krävs för påvisande av SARS-CoV-2-virus. I parallella linjer, med hjälp av avancerade urvalsmetoder för proteinteknik, kommer vi att utveckla artificiella proteiner som nya biologiska enheter med en ny bindningsfunktion som specialiserat sig på den specifika bindningen av inaktiverade virus. Baserat på kombinationen av bindande olika epitoper planerar vi att denna molekylära plattform kommer att uppnå hög känslighet och specificitet för olika typer av virus, inklusive SARS-CoV-2. Detta projekt, som kommer att genomföras i Košice, kommer att leda till vetenskapliga publikationer, ”koncepttest” och patent, nämligen: I) metod för ”koncepttest” för selektiv, snabb, billig och på plats detektion av SARS-CoV-2 med omedelbar överföring av resultatet till den relevanta databasen, ii) funktionell laboratorieprototyp av detektionssystem för olika typer av virus, inklusive SARS-CoV-2-virus.
