Głównym problemem jest to, że ładunki zanieczyszczeń (według BDS7, SM, azotu całkowitego, fosforu ogólnego) w oczyszczalni ścieków w Wilnie przekraczają średnie roczne stężenie azotu w istniejącym projekcie, oczyszczaniu i odprowadzaniu ścieków, a infrastruktura oczyszczalni ścieków wybudowanej kilkadziesiąt lat temu jest zużywana, dlatego też w Wilnie i w części dzielnicy Wilna nie zapewniono odpowiedniego oczyszczania ścieków. Celem projektu jest podniesienie jakości usług gospodarowania ściekami dla mieszkańców, przedsiębiorstw, instytucji i gości w Wilnie i Wilnie, zapewnienie, że średnie roczne stężenie zanieczyszczeń w zrzutach ścieków jest zgodne z wymogami określonymi w ustawie o zaopatrzeniu w wodę pitną i gospodarce ściekami oraz przepisach podustawowych oraz w określonych dla Spółki warunkach odprowadzania ścieków, które zawarte są w wydanych przedsiębiorstwom zezwoleniach na zanieczyszczenia.