De algemene doelstelling van het project is de verbeterde leef- en werkomgeving in het Karelia CBC-programmagebied. Het hoofddoel van PeatStop is beter afvoerwaterbeheer via monitoring en nieuwe filteroplossingen. Meer in het bijzonder streeft PeatStop naar de ontwikkeling van grensoverschrijdende oplossingen om de conditie van stedelijke waterlichamen te verbeteren door de invoering van effectieve monitoring en het gebruik van nieuwe milieuveilige waterfilteroplossingen.