Het financieringsinstrument van het Fonds voor waterbeheer zal erop gericht zijn de beschikbaarheid en kwaliteit van de drinkwatervoorziening en het afvalwaterbeheer te verbeteren teneinde het milieu te beschermen tegen de schadelijke effecten van afvalwater, het aantal gebruikers dat is aangesloten op gecentraliseerde systemen en het totale aantal gebruikers van gecentraliseerde systemen te verhogen, de kwaliteit en efficiëntie van diensten te verbeteren en verliezen en ongevallen in netwerken te verminderen. Volgens de analyse van de voorlopige beoordeling bedraagt de totale financieringskloof in de sector waterbeheer ongeveer 3,5 miljard EUR. De Republiek Litouwen exploiteert meer dan 14 000 kilometer drinkwatervoorziening en meer dan 10 000 kilometer afvalwateropvangnetten, waarvan meer dan de helft 60 % of meer is afgenomen en zeer slecht waterverlies en infiltratiepercentages heeft. De aansluiting van de bevolking op drinkwatervoorzienings- en afvalwateropvangnetten verschilt aanzienlijk van gemeente tot gemeente. Om het aandeel van 95 % van de aangesloten consumenten te bereiken, moet ongeveer 13 % van de consumenten worden aangesloten op de drinkwaternetten en moet 16 % van de consumenten op het rioleringsnet worden aangesloten. Het Fonds zal openbare drinkwaterleveranciers en afvalwaterbeheerders langetermijnleningen (tot 20 jaar) verstrekken voor de ontwikkeling en renovatie van drinkwatervoorzienings- en afvalwateropvangnetten.